MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia psittaci WC chromosome

Total Repeats: 22186

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018624	CGA	2	6	170	175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407460164
2	NC_018624	AGA	2	6	188	193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407460164
3	NC_018624	CTT	2	6	225	230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407460164
4	NC_018624	T	7	7	256	262	0 %	100 %	0 %	0 %	407460164
5	NC_018624	AAGG	2	8	266	273	50 %	0 %	50 %	0 %	407460164
6	NC_018624	A	6	6	274	279	100 %	0 %	0 %	0 %	407460164
7	NC_018624	GT	3	6	309	314	0 %	50 %	50 %	0 %	407460164
8	NC_018624	TCT	2	6	331	336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407460164
9	NC_018624	A	7	7	478	484	100 %	0 %	0 %	0 %	407460164
10	NC_018624	TG	3	6	498	503	0 %	50 %	50 %	0 %	407460164
11	NC_018624	TAT	2	6	553	558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407460164
12	NC_018624	ATG	2	6	579	584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407460164
13	NC_018624	GCGT	2	8	588	595	0 %	25 %	50 %	25 %	407460164
14	NC_018624	TGT	2	6	640	645	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407460164
15	NC_018624	ATG	2	6	659	664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407460164
16	NC_018624	TC	3	6	727	732	0 %	50 %	0 %	50 %	407460164
17	NC_018624	ACA	2	6	950	955	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407460164
18	NC_018624	AGC	2	6	964	969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407460164
19	NC_018624	GTG	2	6	981	986	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407460164
20	NC_018624	AGC	3	9	1000	1008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407460164
21	NC_018624	CTA	2	6	1011	1016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407460164
22	NC_018624	GGT	2	6	1020	1025	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407460164
23	NC_018624	CTT	2	6	1128	1133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407460164
24	NC_018624	CTT	2	6	1225	1230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407460165
25	NC_018624	AC	3	6	1295	1300	50 %	0 %	0 %	50 %	407460165
26	NC_018624	TTAA	2	8	1353	1360	50 %	50 %	0 %	0 %	407460165
27	NC_018624	ACA	2	6	1365	1370	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407460165
28	NC_018624	ATG	2	6	1413	1418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407460165
29	NC_018624	GT	3	6	1461	1466	0 %	50 %	50 %	0 %	407460165
30	NC_018624	TTA	2	6	1512	1517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407460165
31	NC_018624	TAG	2	6	1576	1581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407460165
32	NC_018624	TC	3	6	1584	1589	0 %	50 %	0 %	50 %	407460165
33	NC_018624	TAG	2	6	1714	1719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407460165
34	NC_018624	CTA	2	6	1768	1773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407460165
35	NC_018624	TTC	2	6	1789	1794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407460165
36	NC_018624	TG	3	6	1888	1893	0 %	50 %	50 %	0 %	407460165
37	NC_018624	ATA	2	6	1989	1994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407460165
38	NC_018624	CTT	2	6	2056	2061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407460165
39	NC_018624	GAA	2	6	2067	2072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407460165
40	NC_018624	TGA	2	6	2128	2133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407460165
41	NC_018624	GAT	2	6	2146	2151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407460165
42	NC_018624	GTT	2	6	2182	2187	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407460165
43	NC_018624	CTT	2	6	2206	2211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407460165
44	NC_018624	T	6	6	2210	2215	0 %	100 %	0 %	0 %	407460165
45	NC_018624	T	8	8	2289	2296	0 %	100 %	0 %	0 %	407460165
46	NC_018624	TAA	2	6	2368	2373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407460165
47	NC_018624	GAA	2	6	2415	2420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407460165
48	NC_018624	AGAT	2	8	2543	2550	50 %	25 %	25 %	0 %	407460165
49	NC_018624	T	7	7	2617	2623	0 %	100 %	0 %	0 %	407460166
50	NC_018624	T	8	8	2628	2635	0 %	100 %	0 %	0 %	407460166
51	NC_018624	AGT	2	6	2642	2647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407460166
52	NC_018624	TTA	2	6	2655	2660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407460166
53	NC_018624	TCC	2	6	2684	2689	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407460166
54	NC_018624	T	6	6	2729	2734	0 %	100 %	0 %	0 %	407460166
55	NC_018624	TTC	2	6	2777	2782	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407460166
56	NC_018624	GA	3	6	2785	2790	50 %	0 %	50 %	0 %	407460166
57	NC_018624	TTA	2	6	2802	2807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407460166
58	NC_018624	TGTT	2	8	2840	2847	0 %	75 %	25 %	0 %	407460166
59	NC_018624	T	6	6	2884	2889	0 %	100 %	0 %	0 %	407460166
60	NC_018624	T	6	6	2896	2901	0 %	100 %	0 %	0 %	407460166
61	NC_018624	AGA	2	6	2933	2938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407460166
62	NC_018624	GAAG	2	8	2951	2958	50 %	0 %	50 %	0 %	407460166
63	NC_018624	TAT	2	6	2971	2976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407460166
64	NC_018624	AGTA	2	8	2981	2988	50 %	25 %	25 %	0 %	407460166
65	NC_018624	TAT	2	6	3005	3010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407460166
66	NC_018624	T	6	6	3010	3015	0 %	100 %	0 %	0 %	407460166
67	NC_018624	GAA	2	6	3216	3221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407460167
68	NC_018624	TTTG	2	8	3299	3306	0 %	75 %	25 %	0 %	407460167
69	NC_018624	TCCT	2	8	3325	3332	0 %	50 %	0 %	50 %	407460167
70	NC_018624	GA	3	6	3339	3344	50 %	0 %	50 %	0 %	407460167
71	NC_018624	GAAAA	2	10	3355	3364	80 %	0 %	20 %	0 %	407460167
72	NC_018624	ATG	2	6	3421	3426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407460167
73	NC_018624	AGT	2	6	3488	3493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407460167
74	NC_018624	CTT	2	6	3542	3547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407460167
75	NC_018624	CAA	2	6	3627	3632	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407460167
76	NC_018624	ATG	2	6	3660	3665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407460167
77	NC_018624	ATC	2	6	3778	3783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407460167
78	NC_018624	TGG	2	6	3891	3896	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407460167
79	NC_018624	AGA	2	6	4142	4147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407460167
80	NC_018624	T	6	6	4190	4195	0 %	100 %	0 %	0 %	407460167
81	NC_018624	TAA	2	6	4208	4213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407460167
82	NC_018624	AT	3	6	4226	4231	50 %	50 %	0 %	0 %	407460167
83	NC_018624	GAA	2	6	4245	4250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407460167
84	NC_018624	AGC	2	6	4283	4288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407460167
85	NC_018624	TAA	2	6	4312	4317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407460167
86	NC_018624	AGGAG	2	10	4412	4421	40 %	0 %	60 %	0 %	407460167
87	NC_018624	AGA	2	6	4432	4437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407460167
88	NC_018624	CTT	2	6	4449	4454	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407460167
89	NC_018624	ATG	2	6	4473	4478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407460167
90	NC_018624	GAT	2	6	4524	4529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407460167
91	NC_018624	GCT	2	6	4578	4583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407460167
92	NC_018624	CT	3	6	4728	4733	0 %	50 %	0 %	50 %	407460167
93	NC_018624	GAA	2	6	4808	4813	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407460167
94	NC_018624	CTGTGG	2	12	4819	4830	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	407460167
95	NC_018624	AAG	2	6	4831	4836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407460167
96	NC_018624	TGG	2	6	4909	4914	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407460167
97	NC_018624	AAG	2	6	5008	5013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407460167
98	NC_018624	AGA	2	6	5111	5116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407460167
99	NC_018624	TTA	2	6	5131	5136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407460167
100	NC_018624	CAA	2	6	5219	5224	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407460167
101	NC_018624	GAAA	2	8	5254	5261	75 %	0 %	25 %	0 %	407460167
102	NC_018624	T	7	7	5456	5462	0 %	100 %	0 %	0 %	407460168
103	NC_018624	AGA	2	6	5519	5524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407460168
104	NC_018624	CGAG	2	8	5525	5532	25 %	0 %	50 %	25 %	407460168
105	NC_018624	TGG	2	6	5585	5590	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407460168
106	NC_018624	TAT	2	6	5620	5625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407460168
107	NC_018624	GTT	2	6	5666	5671	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407460168
108	NC_018624	CAA	2	6	5682	5687	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407460168
109	NC_018624	GAT	2	6	5709	5714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407460168
110	NC_018624	TGT	2	6	5729	5734	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407460168
111	NC_018624	GGA	2	6	5751	5756	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407460168
112	NC_018624	T	6	6	5785	5790	0 %	100 %	0 %	0 %	407460168
113	NC_018624	CAA	2	6	5862	5867	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407460168
114	NC_018624	TGA	2	6	5924	5929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407460168
115	NC_018624	GAT	2	6	5930	5935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407460168
116	NC_018624	TGT	3	9	5982	5990	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407460168
117	NC_018624	TGA	2	6	6046	6051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407460168
118	NC_018624	GCT	2	6	6062	6067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407460168
119	NC_018624	T	7	7	6071	6077	0 %	100 %	0 %	0 %	407460168
120	NC_018624	TGC	2	6	6221	6226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407460168
121	NC_018624	TGA	2	6	6242	6247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407460168
122	NC_018624	GAA	2	6	6273	6278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407460168
123	NC_018624	A	6	6	6277	6282	100 %	0 %	0 %	0 %	407460168
124	NC_018624	GAG	2	6	6286	6291	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407460168
125	NC_018624	TTC	2	6	6296	6301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407460168
126	NC_018624	CCT	2	6	6303	6308	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407460168
127	NC_018624	CTT	2	6	6349	6354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407460168
128	NC_018624	GTT	2	6	6391	6396	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407460168
129	NC_018624	CT	3	6	6468	6473	0 %	50 %	0 %	50 %	407460168
130	NC_018624	T	6	6	6483	6488	0 %	100 %	0 %	0 %	407460168
131	NC_018624	ACA	2	6	6549	6554	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407460168
132	NC_018624	ATA	2	6	6589	6594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407460168
133	NC_018624	CAA	2	6	6633	6638	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407460168
134	NC_018624	T	6	6	6675	6680	0 %	100 %	0 %	0 %	407460169
135	NC_018624	TAAT	2	8	6731	6738	50 %	50 %	0 %	0 %	407460169
136	NC_018624	TGTTT	2	10	6760	6769	0 %	80 %	20 %	0 %	407460169
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398	NC_018624	CGT	2	6	19800	19805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407460179
399	NC_018624	TGC	2	6	19838	19843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407460179
400	NC_018624	GTT	2	6	19876	19881	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407460179
401	NC_018624	A	7	7	19967	19973	100 %	0 %	0 %	0 %	407460179
402	NC_018624	GTT	2	6	20025	20030	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407460179
403	NC_018624	TAC	2	6	20084	20089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407460179
404	NC_018624	AC	3	6	20113	20118	50 %	0 %	0 %	50 %	407460179
405	NC_018624	ATC	2	6	20135	20140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407460179
406	NC_018624	GCT	2	6	20157	20162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407460179
407	NC_018624	T	6	6	20162	20167	0 %	100 %	0 %	0 %	407460179
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412	NC_018624	AGT	2	6	20473	20478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407460180
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416	NC_018624	CCT	2	6	20672	20677	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407460180
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420	NC_018624	GCA	2	6	20978	20983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407460180
421	NC_018624	ATT	2	6	21017	21022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407460180
422	NC_018624	A	6	6	21053	21058	100 %	0 %	0 %	0 %	407460180
423	NC_018624	GTT	2	6	21071	21076	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407460180
424	NC_018624	TAAA	2	8	21087	21094	75 %	25 %	0 %	0 %	407460180
425	NC_018624	AGTGT	2	10	21117	21126	20 %	40 %	40 %	0 %	407460180
426	NC_018624	TC	3	6	21144	21149	0 %	50 %	0 %	50 %	407460180
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429	NC_018624	CAA	2	6	21333	21338	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407460180
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432	NC_018624	CTT	2	6	21573	21578	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407460180
433	NC_018624	TATG	2	8	21586	21593	25 %	50 %	25 %	0 %	407460180
434	NC_018624	TTA	2	6	21816	21821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407460181
435	NC_018624	GCA	2	6	21902	21907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407460181
436	NC_018624	GAC	2	6	21987	21992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407460181
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438	NC_018624	TGA	2	6	22084	22089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407460181
439	NC_018624	CGA	2	6	22104	22109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407460181
440	NC_018624	CAA	2	6	22134	22139	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407460181
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453	NC_018624	TGC	2	6	22651	22656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407460181
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458	NC_018624	A	6	6	22731	22736	100 %	0 %	0 %	0 %	407460181
459	NC_018624	GTG	4	12	22746	22757	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407460181
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470	NC_018624	AAC	2	6	23107	23112	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407460181
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491	NC_018624	CTT	2	6	24517	24522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407460182
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496	NC_018624	AATT	2	8	24628	24635	50 %	50 %	0 %	0 %	407460182
497	NC_018624	ATAA	2	8	24695	24702	75 %	25 %	0 %	0 %	407460182
498	NC_018624	T	7	7	24797	24803	0 %	100 %	0 %	0 %	407460183
499	NC_018624	TGT	2	6	24818	24823	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407460183
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